Le Village des sciences de l'Arbois est consacré à l'organisation d'une journée dédiée aux sciences de l'environnement, organisée par des scientifiques avec une approche interdisciplinaire, et visant principalement un public de scolaires. La programmation est volontairement détachée des programmes scolaires, et correspond aux enjeux de la science en train de se faire dans les laboratoires de la métropole.

Le Village des sciences de l’Arbois, labellisé pour la première fois en 2018, est une action unique dans les villages des sciences français avec une double singularité : (1) ce village des sciences est thématiquement focalisé sur les sciences de l!environnement sur un campus de l'environnement  et (2) il arrive à mobiliser un très grand nombre de scientifiques (environ 150/an).

Les enjeux pédagogiques du Village des Sciences sont (1) éveiller les scolaires aux sciences de l’environnement et aux problématiques sociétales liées à l’environnement (changement climatique, risques sismiques, pollution des sols, acidification des océans, impact des nanoparticules, érosion de la biodiversité).(2) sensibiliser les scolaires à la démarche scientifique avec une approche non scolaire, en privilégiant le contact avec les scientifiques, les objets étudiés par les scientifiques et leur instrumentation in situ (3) incarner la science (4) La transition environnementale.

Le village des sciences associe des ateliers pédagogiques interactifs (environ une quarantaine) et des conférences (environ 3).